More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4187 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 496 aa  1003    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  56.4 
 
 		 498 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 501 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  55.37 
 
 		 481 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  56.16 
 
 		 505 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  57.46 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  56.68 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  56.48 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  54.88 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  52.65 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  54.3 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  50.91 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  48.77 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  57.48 
 
 		 518 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  49.7 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  53.33 
 
 		 581 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.72 
 
 		 510 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 512 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.69 
 
 		 522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 505 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  37.8 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  35.62 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34.64 
 
 		 533 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.55 
 
 		 551 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.39 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  34.62 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  34.14 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.2 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.29 
 
 		 461 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.87 
 
 		 475 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.62 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  34.71 
 
 		 502 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.39 
 
 		 521 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 		 480 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  34.81 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 		 540 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  34.75 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  34.2 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.02 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 		 541 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.88 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.35 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.45 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.73 
 
 		 483 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.45 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.35 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  34.35 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.02 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.66 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.62 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.32 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  33.68 
 
 		 490 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.66 
 
 		 480 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07315  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  31.83 
 
 		 492 aa  229  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.223586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.19 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.41 
 
 		 483 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.66 
 
 		 480 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 482 aa  229  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 482 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.35 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.25 
 
 		 496 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.9 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  36.11 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  34.18 
 
 		 490 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.85 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  34.33 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.19 
 
 		 483 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 		 488 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00900  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+), putative  34.07 
 
 		 500 aa  226  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.825171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.41 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  30.53 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0255  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.2 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.97 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.97 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.97 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  33.89 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.37 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.59 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  35.45 
 
 		 483 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.65 
 
 		 495 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  35.68 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>