More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1328 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
526 aa  1036    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  56.01 
 
 
531 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.03 
 
 
551 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  47.43 
 
 
533 aa  456  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 
521 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  50.76 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
538 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.49 
 
 
518 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
518 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.5 
 
 
534 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
521 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
541 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
540 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
525 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  46.79 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
540 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
550 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
519 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
517 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
537 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  49.56 
 
 
547 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 
534 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
525 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.56 
 
 
522 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.67 
 
 
510 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
505 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
505 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
505 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.57 
 
 
505 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
509 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
512 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
486 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 
485 aa  279  9e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
488 aa  276  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
491 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.15 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.15 
 
 
494 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.61 
 
 
506 aa  273  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.09 
 
 
461 aa  273  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  38.27 
 
 
497 aa  272  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
488 aa  272  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
504 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
490 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
489 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
478 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
488 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
489 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
489 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
489 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.08 
 
 
489 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.08 
 
 
489 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
489 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  34.58 
 
 
494 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 
485 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
494 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.71 
 
 
494 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
498 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.72 
 
 
498 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  37.12 
 
 
499 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
494 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
506 aa  266  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  38.48 
 
 
496 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
494 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  34.54 
 
 
490 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  35.67 
 
 
490 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  33.98 
 
 
481 aa  264  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
482 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
494 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
494 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.85 
 
 
494 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.14 
 
 
482 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
475 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
484 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
489 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.09 
 
 
486 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  35.94 
 
 
491 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.92 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.92 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
497 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3841  Aldehyde Dehydrogenase  38.12 
 
 
503 aa  261  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
491 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  32.6 
 
 
496 aa  260  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
493 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.7 
 
 
479 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.2 
 
 
480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  35.88 
 
 
490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  34.15 
 
 
502 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.7 
 
 
479 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.71 
 
 
482 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  34.71 
 
 
482 aa  259  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.71 
 
 
482 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.56 
 
 
493 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  36.94 
 
 
499 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  36.11 
 
 
500 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 
492 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
512 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>