More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 537 aa  1075    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  52.07 
 
 		 521 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.91 
 
 		 534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  54 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.77 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.48 
 
 		 521 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  49.4 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.82 
 
 		 518 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.35 
 
 		 541 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.98 
 
 		 538 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  46.35 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  53.68 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  47.76 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.2 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  48.34 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.91 
 
 		 526 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 		 517 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  49.5 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.5 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.66 
 
 		 510 aa  319  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.33 
 
 		 522 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.68 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 		 482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.58 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 491 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 		 509 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.04 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.11 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.9 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 482 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.9 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.9 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.9 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.43 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.25 
 
 		 482 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.82 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 494 aa  277  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.69 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.88 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.48 
 
 		 490 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.3 
 
 		 483 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.3 
 
 		 483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.04 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.13 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.96 
 
 		 485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 		 484 aa  269  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.37 
 
 		 495 aa  267  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  38 
 
 		 501 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1611  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  40.64 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0291547  decreased coverage  0.00849486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.14 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.03 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6572  aldehyde dehydrogenase  38.5 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.42 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  39.57 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.61 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 482 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.87 
 
 		 480 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.96 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 494 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.29 
 
 		 496 aa  263  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 482 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.4 
 
 		 484 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 498 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>