More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2590 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.9 
 
 		 521 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 525 aa  1065    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  63.2 
 
 		 521 aa  679    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  62.7 
 
 		 518 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.46 
 
 		 540 aa  551  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.52 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.62 
 
 		 550 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  52.28 
 
 		 533 aa  529  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 541 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  54.15 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.77 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.7 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.14 
 
 		 538 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  50.31 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  51.58 
 
 		 517 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.77 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 		 551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.51 
 
 		 517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  55.96 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  52.32 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 526 aa  415  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  47.25 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.91 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.66 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.11 
 
 		 522 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.45 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 509 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.38 
 
 		 480 aa  296  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.18 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 484 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 		 480 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.42 
 
 		 483 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.48 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  39.14 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.2 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.2 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.2 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.75 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.54 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  35.54 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  34.79 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 		 494 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.88 
 
 		 480 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.31 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  35.79 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.88 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.66 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.98 
 
 		 483 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.63 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 490 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 489 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.66 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.32 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.92 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.76 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.44 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.98 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 495 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.99 
 
 		 489 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.88 
 
 		 484 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.96 
 
 		 482 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 485 aa  280  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.48 
 
 		 483 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.88 
 
 		 494 aa  279  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.12 
 
 		 494 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.76 
 
 		 483 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 		 494 aa  279  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.21 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 		 483 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.31 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.48 
 
 		 483 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.22 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  35.61 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 493 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>