More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11748 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
518 aa  1054    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  62.28 
 
 
516 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  62.28 
 
 
517 aa  614  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  53.75 
 
 
521 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
534 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
518 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
521 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.7 
 
 
525 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  46.94 
 
 
531 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 
540 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.82 
 
 
537 aa  465  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  46.88 
 
 
533 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
551 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.64 
 
 
541 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.49 
 
 
526 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.92 
 
 
517 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
519 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
538 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
540 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.09 
 
 
534 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  45.21 
 
 
547 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
525 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.67 
 
 
510 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.14 
 
 
522 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
505 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
505 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
505 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
512 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
484 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
484 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
484 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
500 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
490 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
484 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
488 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
483 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
483 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 
497 aa  263  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.47 
 
 
482 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  35.24 
 
 
510 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.98 
 
 
493 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  36.72 
 
 
485 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.8 
 
 
482 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
482 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
500 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
499 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.47 
 
 
482 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.47 
 
 
479 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  33.93 
 
 
505 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
482 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.11 
 
 
492 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
479 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
482 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0917  succinate-semialdehyde dehydrogenase(NADP+)  34.84 
 
 
476 aa  258  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0952365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 
510 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.48 
 
 
484 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.41 
 
 
486 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  33.19 
 
 
482 aa  256  6e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
485 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  36.83 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.89 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.89 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.89 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.89 
 
 
482 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.78 
 
 
480 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
482 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.14 
 
 
504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.06 
 
 
461 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
484 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
482 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.33 
 
 
480 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  32.72 
 
 
485 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
482 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
482 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.67 
 
 
482 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
489 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
485 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.34 
 
 
484 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  31.04 
 
 
477 aa  251  3e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
489 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.44 
 
 
482 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  34.47 
 
 
531 aa  250  6e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
485 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.44 
 
 
482 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.44 
 
 
482 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  34.44 
 
 
482 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.44 
 
 
482 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
490 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.2 
 
 
485 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
483 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
482 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
488 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>