More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2921 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
534 aa  1070    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  55.67 
 
 
521 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  58.17 
 
 
518 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.5 
 
 
521 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
525 aa  544  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.92 
 
 
550 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.38 
 
 
540 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  52 
 
 
533 aa  511  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.91 
 
 
537 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.2 
 
 
538 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
518 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  55.41 
 
 
516 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
541 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  53.59 
 
 
517 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  48.42 
 
 
531 aa  465  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
517 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
540 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.5 
 
 
526 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  52.55 
 
 
534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  51.38 
 
 
547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
525 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.46 
 
 
510 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.55 
 
 
522 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
505 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
505 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
505 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  35.59 
 
 
484 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  37.56 
 
 
512 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.6 
 
 
493 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
509 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.98 
 
 
496 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.79 
 
 
486 aa  247  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  34.93 
 
 
503 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  34.6 
 
 
494 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.81 
 
 
494 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
501 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.84 
 
 
493 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
504 aa  243  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.03 
 
 
494 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
495 aa  243  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
510 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  34.18 
 
 
494 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
485 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  34.39 
 
 
494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.18 
 
 
494 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
483 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  35.17 
 
 
490 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  34.18 
 
 
494 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  34.18 
 
 
494 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  36.03 
 
 
497 aa  239  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  34.76 
 
 
494 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.2 
 
 
494 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
484 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
490 aa  238  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  37 
 
 
517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
483 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.33 
 
 
484 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  32.57 
 
 
475 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
483 aa  236  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  34.82 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  35.15 
 
 
506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
490 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.87 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
489 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.46 
 
 
495 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.96 
 
 
475 aa  234  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  34.71 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.92 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.92 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.92 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  30.92 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
490 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  31.1 
 
 
483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  32.11 
 
 
496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
495 aa  234  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
505 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
491 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
483 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  36.2 
 
 
489 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  32.55 
 
 
490 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
492 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  31.9 
 
 
496 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
489 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
489 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  36.53 
 
 
512 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.97 
 
 
489 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.72 
 
 
486 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
480 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
489 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.14 
 
 
498 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>