More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0627 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
518 aa  1054    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  76.85 
 
 
521 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  68.98 
 
 
521 aa  735    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.7 
 
 
525 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.17 
 
 
534 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  54.79 
 
 
533 aa  532  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
540 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.79 
 
 
550 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.05 
 
 
541 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  54 
 
 
537 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.63 
 
 
538 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  50.52 
 
 
516 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  51.5 
 
 
531 aa  472  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.31 
 
 
519 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
551 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
517 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  53.23 
 
 
540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.24 
 
 
525 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  50.82 
 
 
534 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.33 
 
 
522 aa  350  4e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.23 
 
 
510 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
512 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.16 
 
 
509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
479 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
505 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
479 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
486 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
505 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
505 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 
480 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.3 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.35 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.53 
 
 
483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.72 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
484 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.74 
 
 
483 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.97 
 
 
482 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
500 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
500 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 
488 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 
504 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.83 
 
 
491 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
484 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.31 
 
 
485 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
482 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.18 
 
 
480 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.74 
 
 
483 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.96 
 
 
480 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.96 
 
 
480 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  297  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.93 
 
 
482 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
489 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.93 
 
 
482 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.45 
 
 
493 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.96 
 
 
480 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.72 
 
 
482 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.88 
 
 
485 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
490 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
493 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.58 
 
 
489 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.74 
 
 
480 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
494 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.58 
 
 
489 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
484 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  293  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.56 
 
 
489 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
489 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
484 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  36.24 
 
 
477 aa  291  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
489 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.56 
 
 
488 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
486 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
490 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
479 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
479 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
491 aa  290  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
483 aa  290  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.66 
 
 
483 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
483 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
488 aa  289  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
496 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
487 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
484 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
489 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
488 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>