More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2095 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
516 aa  1037    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.23 
 
 
510 aa  296  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
501 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
505 aa  286  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  41.59 
 
 
503 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
499 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  40.19 
 
 
498 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.2 
 
 
522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
496 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  39.13 
 
 
510 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
508 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  39.47 
 
 
531 aa  266  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
505 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
505 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
505 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
537 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  38.08 
 
 
496 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  34.62 
 
 
510 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
481 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  38.36 
 
 
521 aa  261  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
512 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  38.5 
 
 
509 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
499 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
540 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
551 aa  256  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.05 
 
 
526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
550 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
518 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 
533 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
498 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  38.06 
 
 
516 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
494 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
521 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
538 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
489 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
512 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
517 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
548 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0440  aldehyde dehydrogenase  30.19 
 
 
483 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461443  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.18 
 
 
486 aa  230  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  38.93 
 
 
517 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1254  aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
471 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2238  aldehyde dehydrogenase  31.49 
 
 
472 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
541 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  32.82 
 
 
524 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  35.16 
 
 
501 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
490 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  39.09 
 
 
473 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.47 
 
 
518 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  36.08 
 
 
511 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  36.3 
 
 
483 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  36.09 
 
 
468 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
510 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
519 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.53 
 
 
505 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  27.64 
 
 
459 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  35.67 
 
 
468 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
489 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  34.15 
 
 
457 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  31.53 
 
 
475 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  34.85 
 
 
443 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.84 
 
 
534 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0539  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.8 
 
 
478 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.809876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
503 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
491 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  32.52 
 
 
491 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  34.66 
 
 
483 aa  217  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  34.96 
 
 
483 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
487 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.63 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  36.3 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0116  Aldehyde Dehydrogenase  37.68 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4757  aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  32.8 
 
 
502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1344  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.18 
 
 
508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0449  Aldehyde Dehydrogenase  30.96 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  39.56 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  34.24 
 
 
454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  35.13 
 
 
475 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2010  aldehyde dehydrogenase  30.32 
 
 
459 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1977  aldehyde dehydrogenase  30.32 
 
 
459 aa  213  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.205682  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
487 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
496 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
487 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  35.51 
 
 
483 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
517 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  31.09 
 
 
454 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  39.15 
 
 
488 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 
485 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>