More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3839 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 503 aa  991    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  62.01 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  61.4 
 
 		 498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.45 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  60.73 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  58.4 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  60.45 
 
 		 498 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  60.9 
 
 		 501 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  55.11 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  55.89 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  51.02 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  57.27 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 		 581 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.14 
 
 		 510 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.78 
 
 		 522 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 516 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  37.44 
 
 		 510 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  37.18 
 
 		 533 aa  280  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  36.06 
 
 		 524 aa  276  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 551 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90594  Meiotic Sister-Chromatid recombination aldehyde dehydrogenase  31.43 
 
 		 616 aa  251  3e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.308604 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  36.5 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.57 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  37.67 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 		 467 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 480 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.14 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05870  meiotic recombination-related protein, putative  32.09 
 
 		 631 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.137863  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.97 
 
 		 483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01570  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  32.91 
 
 		 561 aa  240  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0842141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  34.61 
 
 		 521 aa  239  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.54 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.08 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.54 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.64 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.82 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 503 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 550 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.01 
 
 		 483 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.33 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.19 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.11 
 
 		 483 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 503 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.11 
 
 		 483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  34.33 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 479 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.75 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.11 
 
 		 483 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 		 480 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.64 
 
 		 496 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.81 
 
 		 480 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.18 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 540 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  35.36 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 		 491 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.76 
 
 		 526 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.69 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  33.86 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.36 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.69 
 
 		 490 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 		 476 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.13 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.22 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.48 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.98 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.75 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>