More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6115 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
501 aa  996    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 
505 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  57.32 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.18 
 
 
499 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  58.56 
 
 
496 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  57.17 
 
 
496 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 
481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  54.83 
 
 
510 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  57.73 
 
 
494 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
498 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  59.26 
 
 
503 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  53.97 
 
 
499 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
548 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  58.33 
 
 
581 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  59.38 
 
 
518 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  54.34 
 
 
508 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.59 
 
 
510 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.59 
 
 
522 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
516 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
512 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
509 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
505 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
505 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
505 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  39.29 
 
 
533 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  40.72 
 
 
531 aa  277  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
551 aa  276  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  36.34 
 
 
524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  36.24 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
521 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  37.53 
 
 
516 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
525 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.65 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
540 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.32 
 
 
538 aa  252  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
526 aa  249  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
521 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0883  aldehyde dehydrogenase  35.99 
 
 
453 aa  247  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.26 
 
 
461 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
550 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.85 
 
 
493 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
474 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 
483 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
486 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.4 
 
 
483 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
518 aa  239  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.16 
 
 
483 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
540 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
469 aa  237  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.46 
 
 
480 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.66 
 
 
518 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 
453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.73 
 
 
483 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.8 
 
 
480 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.46 
 
 
480 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.8 
 
 
496 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.58 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 
547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.58 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.58 
 
 
480 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  35.91 
 
 
506 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.91 
 
 
505 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
487 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  36.2 
 
 
517 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.48 
 
 
480 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 
488 aa  231  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4075  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.17 
 
 
496 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
488 aa  231  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  34.83 
 
 
479 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
501 aa  230  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
541 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.79 
 
 
476 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  34.77 
 
 
476 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1506  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
472 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 
443 aa  228  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  34.35 
 
 
490 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
491 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.87 
 
 
489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.55 
 
 
494 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.63 
 
 
479 aa  226  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.55 
 
 
494 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.05 
 
 
476 aa  226  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
482 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  34.5 
 
 
455 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
534 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
494 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
494 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.89 
 
 
455 aa  226  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
485 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
471 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.81 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  33.62 
 
 
508 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
489 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0134  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
495 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.29 
 
 
489 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4306  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
485 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.9 
 
 
494 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>