More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3504 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  951    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2258  aldehyde dehydrogenase  58.55 
 
 
473 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0191604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2607  aldehyde Dehydrogenase  55.01 
 
 
473 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1506  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
472 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0080  Aldehyde Dehydrogenase  47.61 
 
 
475 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1123  putative aldehyde dehydrogenase  46.52 
 
 
475 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1106  putative aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
475 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.01 
 
 
510 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  40.94 
 
 
509 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
512 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.19 
 
 
522 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  35.81 
 
 
531 aa  256  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
533 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  34.78 
 
 
521 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
521 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  35.67 
 
 
499 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  38.14 
 
 
508 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.94 
 
 
540 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.34 
 
 
551 aa  217  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.01 
 
 
538 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.95 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  31.85 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
501 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
518 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.8 
 
 
475 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.36 
 
 
493 aa  210  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
471 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  31.66 
 
 
505 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0804  aldehyde dehydrogenase  33.49 
 
 
500 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  31.99 
 
 
479 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  32.88 
 
 
479 aa  207  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  37.25 
 
 
465 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  40.06 
 
 
462 aa  206  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  37.25 
 
 
465 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  35.49 
 
 
453 aa  206  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  32.65 
 
 
479 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  32.88 
 
 
479 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
501 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  32.65 
 
 
479 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  32.65 
 
 
479 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  32.65 
 
 
479 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  34.17 
 
 
478 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 
454 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.29 
 
 
517 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  36.76 
 
 
462 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
481 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
477 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  32.42 
 
 
479 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  32.42 
 
 
479 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
477 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.23 
 
 
509 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
540 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  32.65 
 
 
479 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.49 
 
 
541 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  34.09 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.26 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.13 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 
443 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  34.5 
 
 
516 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9116  Betaine-aldehyde dehydrogenase  32.8 
 
 
484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  32.17 
 
 
510 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
505 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1625  aldehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
491 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  35.2 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 
494 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  33.06 
 
 
496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.98 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  32.84 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  33.06 
 
 
496 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
461 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
494 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1640  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  29.51 
 
 
494 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.95 
 
 
455 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.69 
 
 
496 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  33.14 
 
 
504 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 
498 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  35.93 
 
 
493 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
478 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
550 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  39.85 
 
 
534 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  36.05 
 
 
503 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1948  benzaldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
492 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  31.63 
 
 
494 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  31.63 
 
 
494 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0145  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.19 
 
 
480 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514167  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
503 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.63 
 
 
494 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>