More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1506 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1506  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 472 aa  970    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 		 474 aa  500  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2258  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0191604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2607  aldehyde Dehydrogenase  50.32 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1123  putative aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0080  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1106  putative aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 		 512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.9 
 
 		 522 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.73 
 
 		 510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 		 509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.97 
 
 		 533 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.72 
 
 		 540 aa  232  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  33.55 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  31.87 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  31.29 
 
 		 521 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.82 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.6 
 
 		 521 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  32.96 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.38 
 
 		 443 aa  213  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3841  Aldehyde Dehydrogenase  32.51 
 
 		 503 aa  213  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.84 
 
 		 540 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  30.15 
 
 		 493 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.24 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  32.62 
 
 		 455 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 		 499 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  32.16 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  34.21 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  31.74 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  31.22 
 
 		 489 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  30.47 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  31.96 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  31.44 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  31 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.77 
 
 		 494 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 		 496 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.88 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.55 
 
 		 494 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.28 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.65 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  30.37 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.13 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  32.07 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.13 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 		 494 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  30.31 
 
 		 455 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  29.18 
 
 		 482 aa  202  7e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  36.72 
 
 		 465 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 		 494 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  31.91 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  31.22 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  36.42 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.09 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  29.3 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.38 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  32.53 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.25 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  30.46 
 
 		 479 aa  200  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  32.88 
 
 		 476 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  29.94 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  29.94 
 
 		 496 aa  199  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  32.17 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  32.17 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  32.17 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  31.26 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  31.92 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  31.92 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4763  Aldehyde Dehydrogenase  32.87 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  32.17 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  32.17 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 		 496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  31.92 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  32.42 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  31.7 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  32.98 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.28 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.27 
 
 		 479 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  30.83 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 		 548 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  30.67 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.49 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  31.92 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.05 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  31.25 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  29.67 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  30.02 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  31.79 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.59 
 
 		 479 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.55 
 
 		 498 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  34.11 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.59 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>