More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3619 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  94.39 
 
 		 498 aa  841    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 481 aa  952    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  59.46 
 
 		 505 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  59.67 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  58.18 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  58.23 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  57.65 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  55.37 
 
 		 496 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  58.47 
 
 		 494 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  60.33 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  57.88 
 
 		 501 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 		 548 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  58.98 
 
 		 518 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  52.38 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  55.16 
 
 		 581 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.24 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.06 
 
 		 510 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.87 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  36.17 
 
 		 510 aa  271  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  36.01 
 
 		 521 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  39.3 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 		 540 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  35.38 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.96 
 
 		 521 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  36.78 
 
 		 516 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34.55 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.6 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.01 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0883  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.57 
 
 		 480 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.15 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.98 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.09 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.57 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.72 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.57 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.71 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.28 
 
 		 483 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.03 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 482 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.29 
 
 		 505 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 550 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 496 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.69 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.35 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.48 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.35 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.06 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  34.06 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.06 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.06 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.84 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.69 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.01 
 
 		 491 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.14 
 
 		 482 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 		 483 aa  236  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.14 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.93 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.5 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.48 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.99 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.48 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.99 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.62 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.65 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.62 
 
 		 482 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 		 479 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  37.44 
 
 		 453 aa  233  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.26 
 
 		 483 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.04 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.68 
 
 		 483 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  37.25 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  34.51 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  34.06 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.67 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.9 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.9 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.9 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.14 
 
 		 480 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>