More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3908 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1016    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  64.73 
 
 
494 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
499 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  59.35 
 
 
496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  56.4 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  58.66 
 
 
505 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  61.4 
 
 
503 aa  548  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
481 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  58.42 
 
 
501 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  56.42 
 
 
510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
498 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
548 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  50.31 
 
 
499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  55.12 
 
 
581 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  50.62 
 
 
508 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.05 
 
 
510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.13 
 
 
522 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  36.4 
 
 
510 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  38.29 
 
 
512 aa  280  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  36.69 
 
 
533 aa  280  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
516 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
505 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
505 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
505 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.17 
 
 
483 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  34.34 
 
 
521 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.11 
 
 
551 aa  264  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  37.15 
 
 
531 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.17 
 
 
480 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.38 
 
 
480 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
540 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 
505 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.95 
 
 
480 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.95 
 
 
480 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  34.18 
 
 
524 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.09 
 
 
483 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.65 
 
 
483 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.51 
 
 
480 aa  256  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
479 aa  256  9e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.14 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
503 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
484 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  35.01 
 
 
516 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.07 
 
 
455 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.33 
 
 
482 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.33 
 
 
482 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.33 
 
 
482 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.78 
 
 
482 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 
482 aa  251  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.78 
 
 
482 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.78 
 
 
482 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.78 
 
 
482 aa  250  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.59 
 
 
483 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.78 
 
 
482 aa  250  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.56 
 
 
482 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
503 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  34.71 
 
 
490 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35 
 
 
482 aa  250  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
489 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  34.82 
 
 
490 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
480 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  37.02 
 
 
495 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.11 
 
 
482 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.18 
 
 
486 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.3 
 
 
480 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
469 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
491 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  32.83 
 
 
466 aa  247  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  34.1 
 
 
494 aa  246  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.85 
 
 
482 aa  246  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
486 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.12 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
550 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.14 
 
 
483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.34 
 
 
491 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 
485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  33.13 
 
 
502 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
480 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.04 
 
 
483 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
482 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.26 
 
 
483 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
526 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  33.26 
 
 
479 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  34.6 
 
 
480 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
469 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1907  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
485 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.226218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.14 
 
 
496 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.69 
 
 
490 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.04 
 
 
462 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.04 
 
 
483 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
521 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  35.01 
 
 
471 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.04 
 
 
483 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>