More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1053 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  69.77 
 
 		 496 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1016    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  64.05 
 
 		 499 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  59.55 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  59.46 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  58.66 
 
 		 498 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  62.01 
 
 		 503 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  58.22 
 
 		 498 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 		 501 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  56.16 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  61.48 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  53.69 
 
 		 548 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  51.13 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  56.88 
 
 		 581 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  52.46 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  55.36 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.96 
 
 		 510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.35 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  39.1 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  37.74 
 
 		 524 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  40.49 
 
 		 516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  37.85 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.48 
 
 		 493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  37.42 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  37.14 
 
 		 521 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 488 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.95 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 476 aa  256  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.82 
 
 		 492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 521 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 		 540 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.88 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.13 
 
 		 483 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.2 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.2 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.55 
 
 		 483 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 503 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.56 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  36.65 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.27 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.91 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 489 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  36.46 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  33.91 
 
 		 483 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.91 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.18 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.91 
 
 		 461 aa  247  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.9 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.97 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.42 
 
 		 483 aa  246  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.91 
 
 		 483 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.6 
 
 		 540 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.91 
 
 		 483 aa  246  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.78 
 
 		 482 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.7 
 
 		 483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.7 
 
 		 483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.7 
 
 		 483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.97 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.47 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.07 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  37.13 
 
 		 494 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.47 
 
 		 500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 		 489 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  38.39 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 		 482 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 		 486 aa  243  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.24 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.24 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.56 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.02 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 550 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.24 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  34.48 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 538 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>