More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4702 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  73.51 
 
 
455 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
457 aa  937    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  54 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  41.31 
 
 
462 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  42.09 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
462 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
461 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  36.62 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  36.4 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  36.3 
 
 
489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
461 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  34.78 
 
 
466 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
471 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
466 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  36.96 
 
 
461 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  36.17 
 
 
461 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
461 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
462 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.82 
 
 
510 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  36.14 
 
 
460 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 
492 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
462 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.81 
 
 
522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  40.18 
 
 
463 aa  283  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
462 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
462 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
459 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  38 
 
 
477 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  37.17 
 
 
531 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  37.66 
 
 
521 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
477 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
477 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.58 
 
 
505 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  35.04 
 
 
533 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.08 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.92 
 
 
481 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  34.06 
 
 
478 aa  249  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.33 
 
 
443 aa  249  8e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.25 
 
 
491 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
478 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  34.72 
 
 
501 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  34.9 
 
 
483 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
483 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  33.26 
 
 
506 aa  247  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  33.78 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  36.9 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  32.82 
 
 
481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.85 
 
 
461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  34.98 
 
 
480 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
461 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  32.02 
 
 
482 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.43 
 
 
540 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
505 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.81 
 
 
471 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  35.6 
 
 
454 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
505 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
505 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
461 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 
491 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.85 
 
 
521 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 
485 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  34.71 
 
 
496 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 
463 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
468 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  34.42 
 
 
479 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
452 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
489 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  36.82 
 
 
512 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  34.14 
 
 
505 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
477 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  33.26 
 
 
493 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  35.33 
 
 
453 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
483 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  36.54 
 
 
489 aa  236  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
461 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  31.72 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  32.21 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 
535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.41 
 
 
488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 
502 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  34.16 
 
 
469 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
489 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  32.6 
 
 
471 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.2 
 
 
494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  34.08 
 
 
490 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.14 
 
 
490 aa  233  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
483 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  32.3 
 
 
467 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  35.19 
 
 
465 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
488 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
475 aa  233  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.39 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>