More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2692 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0289  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  71.04 
 
 		 483 aa  655    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  1007    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5232  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.68 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88595  normal  0.882474 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3703  aldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 		 498 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  59.72 
 
 		 525 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5500  Aldehyde Dehydrogenase  62.68 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3471  aldehyde dehydrogenase  59.46 
 
 		 498 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.793386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.05 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.63 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.63 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.42 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.21 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  50.42 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50.42 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.79 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  50 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.79 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.58 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.61 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3167  hypothetical protein  55.88 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662666  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.95 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.95 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 484 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.56 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.16 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.23 
 
 		 480 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.26 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 485 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.33 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.73 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.08 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.42 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.33 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.33 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.01 
 
 		 485 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.7 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.91 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.25 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 482 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  52 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.46 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.05 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.06 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.22 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.25 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.05 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.22 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.05 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2286  aldehyde dehydrogenase  52.15 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595022  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 		 482 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  49.9 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.7 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 493 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.74 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4422  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  53.51 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 491 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.27 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.12 
 
 		 492 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.72 
 
 		 486 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 		 490 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0577  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.69 
 
 		 497 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289417  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0032  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.52 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105667  normal  0.227937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>