More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1044 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 
474 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
481 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  81.01 
 
 
474 aa  794    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  81.65 
 
 
474 aa  801    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  74.05 
 
 
474 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.89 
 
 
474 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 
474 aa  736    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.14 
 
 
475 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  68.5 
 
 
480 aa  696    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  72.77 
 
 
478 aa  704    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
481 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  75.32 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.35 
 
 
475 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.19 
 
 
481 aa  714    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  81.65 
 
 
481 aa  802    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.11 
 
 
474 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
481 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  980    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.08 
 
 
495 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  81.65 
 
 
474 aa  802    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
481 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  71.73 
 
 
474 aa  722    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
474 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
481 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  74.47 
 
 
474 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
475 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  71.1 
 
 
474 aa  713    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 
474 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.73 
 
 
477 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.42 
 
 
487 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.85 
 
 
486 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
475 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.39 
 
 
479 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
470 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.17 
 
 
470 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
514 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
514 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
470 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.06 
 
 
479 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 
486 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  52 
 
 
477 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  51.9 
 
 
492 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 
477 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  51.17 
 
 
477 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
484 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
479 aa  472  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  52 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  49.16 
 
 
483 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  52.06 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
463 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  49.25 
 
 
476 aa  456  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
506 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
477 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  49.57 
 
 
480 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
477 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
477 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
476 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
477 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
491 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
468 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  48.61 
 
 
476 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
479 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.93 
 
 
490 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  51.42 
 
 
480 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
477 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  48.68 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  49.34 
 
 
472 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 
491 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  50.91 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
488 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
488 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
488 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.84 
 
 
488 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
488 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.25 
 
 
496 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
488 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
491 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
488 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44 
 
 
495 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
501 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
487 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.13 
 
 
490 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
504 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.25 
 
 
494 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>