More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0804 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 		 483 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  983    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  69.29 
 
 		 483 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  56.04 
 
 		 498 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  56.85 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  56.22 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  58.66 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  57.71 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  54.6 
 
 		 481 aa  534  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  59.04 
 
 		 483 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  56.64 
 
 		 483 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  53.22 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  53.62 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  60.46 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  54.49 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  53.42 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  55.9 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  55.19 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  56.67 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  58.25 
 
 		 483 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  59.41 
 
 		 494 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  59.08 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  53.76 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  60.29 
 
 		 483 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  59.29 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  59.29 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 483 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  60.08 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 483 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  53.51 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  51.35 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  58.21 
 
 		 483 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  52.28 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  50.83 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  52.38 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  52.8 
 
 		 482 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  51.87 
 
 		 482 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  52.59 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  47.51 
 
 		 508 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  54.04 
 
 		 482 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  54.04 
 
 		 521 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  54.04 
 
 		 482 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  54.04 
 
 		 521 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  53.83 
 
 		 521 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  47.61 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 		 479 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  39.36 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  39.96 
 
 		 482 aa  329  6e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  38.76 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 		 496 aa  319  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.48 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  39.74 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  39.18 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  38 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.41 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  37.13 
 
 		 489 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  36.15 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 490 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  39.17 
 
 		 486 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  37.21 
 
 		 491 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  36.33 
 
 		 503 aa  293  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 		 490 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 		 490 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  38.13 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  38.58 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  36.72 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 		 493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 		 489 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  35.94 
 
 		 498 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  35.97 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.23 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.04 
 
 		 490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>