More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1998 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  68.81 
 
 		 480 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  78.01 
 
 		 483 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  80.21 
 
 		 483 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  75.73 
 
 		 483 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  78.96 
 
 		 483 aa  735    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  79.46 
 
 		 483 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  81.74 
 
 		 483 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  79.05 
 
 		 483 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 494 aa  987    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  78.03 
 
 		 483 aa  736    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  78.01 
 
 		 483 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  78.75 
 
 		 483 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  78.01 
 
 		 483 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  78.22 
 
 		 483 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  80.29 
 
 		 483 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  77.8 
 
 		 483 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  75.83 
 
 		 483 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  64.38 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  65.42 
 
 		 481 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  62.76 
 
 		 498 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  64.52 
 
 		 483 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  60.37 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  62.71 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  59.79 
 
 		 481 aa  578  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  65.83 
 
 		 483 aa  581  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  63.28 
 
 		 483 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  62.72 
 
 		 466 aa  574  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 		 483 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  62.29 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 482 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  62.71 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  62.55 
 
 		 488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  64.79 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  64.12 
 
 		 481 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  58.63 
 
 		 482 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  64.93 
 
 		 484 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  62.07 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  64.23 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  64.02 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  64.02 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  63.6 
 
 		 482 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  63.18 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  65.06 
 
 		 484 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  61.67 
 
 		 482 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  62.55 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  53.44 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  63.28 
 
 		 483 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.55 
 
 		 521 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.55 
 
 		 521 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  54.28 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  62.34 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.55 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.55 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 		 483 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  43.79 
 
 		 482 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  42.32 
 
 		 484 aa  358  9e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 496 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  47.4 
 
 		 486 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 		 497 aa  329  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 489 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  38.6 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  35.91 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 		 510 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  40.59 
 
 		 510 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 		 480 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 503 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  37.84 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  39.7 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.21 
 
 		 498 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  40.78 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.84 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.32 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.68 
 
 		 480 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.68 
 
 		 480 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  38.38 
 
 		 516 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  35.21 
 
 		 497 aa  292  8e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 492 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>