More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3835 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  75.98 
 
 
483 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  76.81 
 
 
483 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  83.44 
 
 
483 aa  693    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  82.19 
 
 
483 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  974    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  77.43 
 
 
483 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
480 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  80.21 
 
 
494 aa  692    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  79.5 
 
 
483 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  79.71 
 
 
483 aa  748    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  77.23 
 
 
483 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  77.02 
 
 
483 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  73.29 
 
 
483 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  77.02 
 
 
483 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  77.23 
 
 
483 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  78.47 
 
 
483 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  75.98 
 
 
483 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  64.39 
 
 
483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  63.83 
 
 
481 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  64.03 
 
 
481 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  60.75 
 
 
498 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  62.11 
 
 
482 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  63.35 
 
 
482 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
482 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  59.04 
 
 
483 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  61.7 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  63.36 
 
 
466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
483 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  59.83 
 
 
481 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  65.42 
 
 
486 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  61.7 
 
 
483 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
482 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  62.79 
 
 
482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  60.54 
 
 
488 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
481 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  61.99 
 
 
466 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  63.64 
 
 
484 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
483 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  62.11 
 
 
482 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
482 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
482 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
482 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
482 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
482 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
482 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  63.39 
 
 
484 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
479 aa  521  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  53.02 
 
 
483 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 
483 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.73 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.73 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.73 
 
 
521 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  62.73 
 
 
521 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  62.53 
 
 
521 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  51.57 
 
 
508 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
489 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  38.12 
 
 
483 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
480 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
479 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  42.95 
 
 
482 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  46.25 
 
 
486 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
496 aa  343  5e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  40.62 
 
 
484 aa  342  7e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
491 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  37.92 
 
 
486 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
510 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 
497 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
489 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
489 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  39.75 
 
 
510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  36.88 
 
 
486 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  36.68 
 
 
485 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
490 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  37 
 
 
484 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
503 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 
498 aa  299  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
503 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.2 
 
 
493 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  35.42 
 
 
503 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 
516 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  33.6 
 
 
519 aa  293  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  37.94 
 
 
494 aa  292  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 
486 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.65 
 
 
480 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
496 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
498 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0666  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.93 
 
 
492 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  40.6 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36 
 
 
491 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>