More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2401 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  95.85 
 
 		 482 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  99.59 
 
 		 482 aa  956    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  85.68 
 
 		 482 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  84.85 
 
 		 482 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  71.22 
 
 		 483 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  80.5 
 
 		 482 aa  758    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  72.05 
 
 		 483 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  73.08 
 
 		 483 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  65.35 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  68.6 
 
 		 484 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  67.15 
 
 		 482 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  61.28 
 
 		 482 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  59.62 
 
 		 498 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  60.79 
 
 		 481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  58.39 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  60.37 
 
 		 481 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  62.97 
 
 		 483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 		 480 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 		 483 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  58.18 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  59.21 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  67.29 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  67.29 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  67.29 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  67.29 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  56.94 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  63.15 
 
 		 483 aa  534  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  67.08 
 
 		 521 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  59.67 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  63.77 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  63.77 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  52.8 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  53 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  61.46 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  61.9 
 
 		 483 aa  498  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  56.99 
 
 		 481 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  53.88 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  58.37 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  49.69 
 
 		 483 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  54.07 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  52.18 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.71 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  43.51 
 
 		 482 aa  352  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  47.41 
 
 		 486 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  39.92 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  39.83 
 
 		 493 aa  309  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  34.58 
 
 		 496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  34.79 
 
 		 496 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  37.73 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  36.74 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 		 486 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  37.11 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  37.29 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 503 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  34.38 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.08 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.29 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.13 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.13 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  37.66 
 
 		 486 aa  282  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.54 
 
 		 480 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  34.94 
 
 		 503 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.54 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.54 
 
 		 480 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>