More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4023 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  75.36 
 
 
482 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  70.81 
 
 
482 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
482 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  78.26 
 
 
483 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  972    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  75.57 
 
 
482 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  68.94 
 
 
482 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  74.74 
 
 
482 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  83.44 
 
 
483 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  75.36 
 
 
482 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  75.57 
 
 
482 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  74.53 
 
 
482 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  72.26 
 
 
482 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  72.05 
 
 
482 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  67.98 
 
 
482 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  71.49 
 
 
484 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  71.84 
 
 
482 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  64.66 
 
 
481 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  62.11 
 
 
481 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  72.46 
 
 
521 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  72.67 
 
 
482 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  72.67 
 
 
482 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  72.67 
 
 
521 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  72.67 
 
 
521 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  64.24 
 
 
481 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  61.9 
 
 
482 aa  581  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  61.28 
 
 
483 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  59.21 
 
 
498 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
480 aa  571  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  63.56 
 
 
483 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  62.73 
 
 
483 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  65.42 
 
 
483 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  63.41 
 
 
486 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  60.25 
 
 
488 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  65.01 
 
 
483 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  64.39 
 
 
483 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
483 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
483 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 
483 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 
483 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
483 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
483 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
483 aa  529  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 
483 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  57.97 
 
 
466 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  56.22 
 
 
482 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  63.28 
 
 
494 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  65.22 
 
 
483 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  65.01 
 
 
483 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  58.28 
 
 
466 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  58 
 
 
484 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  53.45 
 
 
479 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
483 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 
489 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  53.75 
 
 
508 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  61.9 
 
 
483 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
481 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  48.52 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
480 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  47.5 
 
 
486 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
483 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
479 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  41.25 
 
 
484 aa  347  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
496 aa  317  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
496 aa  316  6e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  39.92 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  38.05 
 
 
491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.32 
 
 
489 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
489 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.32 
 
 
489 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
488 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  42.18 
 
 
489 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
485 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
497 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.87 
 
 
480 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.64 
 
 
510 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
510 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.18 
 
 
496 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
489 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
492 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  39 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  35.54 
 
 
486 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
490 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.53 
 
 
488 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.75 
 
 
492 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  36.33 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  36.33 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  35.83 
 
 
519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  40.8 
 
 
488 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>