More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4915 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  95.02 
 
 
482 aa  841    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  76.6 
 
 
483 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  80.29 
 
 
521 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  80.5 
 
 
482 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  80.5 
 
 
521 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  72.88 
 
 
483 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  80.5 
 
 
482 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  95.02 
 
 
482 aa  836    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  74.53 
 
 
483 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  80.5 
 
 
521 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  94.4 
 
 
482 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  94.4 
 
 
482 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  98.55 
 
 
482 aa  942    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  956    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  66.05 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  65.84 
 
 
482 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  70.87 
 
 
484 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  65.42 
 
 
482 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
482 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  66.95 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  58.91 
 
 
481 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 
482 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  59.96 
 
 
481 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  58.59 
 
 
483 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  66.95 
 
 
482 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  58.66 
 
 
498 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  56.85 
 
 
482 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  59.54 
 
 
481 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  60.67 
 
 
483 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  62.55 
 
 
486 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
483 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
480 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  59.71 
 
 
483 aa  521  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
483 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 
482 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  59.78 
 
 
466 aa  512  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  58.25 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
483 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  51.87 
 
 
483 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  62.55 
 
 
494 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  60.88 
 
 
483 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  61.08 
 
 
483 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
483 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
483 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
483 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  63.29 
 
 
484 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
483 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  59.63 
 
 
483 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 
483 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  61.49 
 
 
483 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  47.5 
 
 
483 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  59.63 
 
 
483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  50.42 
 
 
508 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
480 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  46.24 
 
 
482 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.62 
 
 
483 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  49.59 
 
 
486 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 
480 aa  352  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  41.72 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
496 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
496 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
489 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 
486 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
489 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  34.76 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  38.33 
 
 
491 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
491 aa  299  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 
485 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  35.83 
 
 
506 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  36.17 
 
 
506 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
497 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.07 
 
 
480 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  37.81 
 
 
510 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
490 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.22 
 
 
489 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.22 
 
 
489 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
493 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
504 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  42.69 
 
 
489 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.61 
 
 
510 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  40.86 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.62 
 
 
493 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.52 
 
 
492 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  35.05 
 
 
519 aa  287  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 
492 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.05 
 
 
492 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.05 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>