More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0610 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  75.36 
 
 
483 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  974    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  66.25 
 
 
483 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  66.25 
 
 
483 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  69.36 
 
 
483 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  67.91 
 
 
483 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  64.38 
 
 
481 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  67.7 
 
 
483 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  67.91 
 
 
483 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  67.91 
 
 
483 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  70.81 
 
 
483 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  63.88 
 
 
481 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  68.81 
 
 
494 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  67.49 
 
 
483 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  66.87 
 
 
483 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  60.13 
 
 
498 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 
483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  69.15 
 
 
483 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  58.71 
 
 
481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  70.6 
 
 
483 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  61.7 
 
 
482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  59.75 
 
 
482 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 
482 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  61.9 
 
 
483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  60.04 
 
 
483 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  63.12 
 
 
486 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  60.33 
 
 
488 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  61.28 
 
 
483 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  61.28 
 
 
482 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 
483 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  59.91 
 
 
466 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  61.46 
 
 
482 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  57.08 
 
 
482 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
483 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
481 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  60.33 
 
 
484 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  61.08 
 
 
482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 
482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
482 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  58.28 
 
 
466 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 
482 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  60.87 
 
 
482 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  60.67 
 
 
484 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
483 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
482 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 
479 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  53.35 
 
 
508 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
483 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  52.28 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  57.47 
 
 
521 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  57.47 
 
 
482 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  57.26 
 
 
521 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  57.47 
 
 
482 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  57.47 
 
 
521 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.83 
 
 
483 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  44.59 
 
 
482 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
480 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
480 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  42.39 
 
 
484 aa  345  8e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  46.04 
 
 
486 aa  342  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
479 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 
496 aa  330  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
496 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 
491 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
497 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.6 
 
 
491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
489 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  36.19 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
489 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.35 
 
 
498 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
490 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
489 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 
485 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  36.12 
 
 
497 aa  293  4e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
489 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
489 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
489 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  37.29 
 
 
510 aa  289  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  34.66 
 
 
503 aa  289  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 
516 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.44 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  37.53 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  33.68 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
490 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
466 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
503 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>