More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2418 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
466 aa  951    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  68.6 
 
 
482 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  68.17 
 
 
482 aa  662    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.31 
 
 
479 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  54.53 
 
 
479 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  54.53 
 
 
479 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.53 
 
 
479 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.53 
 
 
479 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  57.83 
 
 
476 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.74 
 
 
479 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.53 
 
 
479 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  54.31 
 
 
479 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.09 
 
 
477 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.31 
 
 
479 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
479 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.31 
 
 
479 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  57.39 
 
 
477 aa  535  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  56.02 
 
 
457 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  53.71 
 
 
475 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  50.9 
 
 
482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.91 
 
 
471 aa  444  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  46.1 
 
 
472 aa  423  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.96 
 
 
475 aa  368  1e-100  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  38.55 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  37.2 
 
 
464 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 
477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
475 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  35.96 
 
 
475 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  35.29 
 
 
484 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
465 aa  311  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  36.66 
 
 
494 aa  307  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.53 
 
 
480 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  37.44 
 
 
474 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.33 
 
 
496 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37 
 
 
483 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  36.27 
 
 
475 aa  300  5e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  37.22 
 
 
474 aa  299  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  35.15 
 
 
473 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
474 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
474 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
474 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  37 
 
 
474 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  37 
 
 
474 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 
477 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.64 
 
 
480 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  36.78 
 
 
474 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 
474 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  37 
 
 
474 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  34.13 
 
 
484 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
468 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
487 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  33.63 
 
 
472 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
486 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.77 
 
 
500 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.5 
 
 
480 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
484 aa  293  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.44 
 
 
480 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  292  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.01 
 
 
482 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.03 
 
 
493 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.01 
 
 
482 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 
480 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
493 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.23 
 
 
480 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
489 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
478 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.23 
 
 
480 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.79 
 
 
482 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
484 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.01 
 
 
482 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.64 
 
 
489 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
472 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
484 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
485 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.33 
 
 
484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.53 
 
 
483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  34.49 
 
 
477 aa  289  7e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
498 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
465 aa  289  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.29 
 
 
510 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
482 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
489 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
484 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.26 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  35.65 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  34.86 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.98 
 
 
483 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
486 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
465 aa  287  4e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>