More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5334 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  1035    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  58.75 
 
 		 510 aa  575  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 		 496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  59 
 
 		 493 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  57.35 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.65 
 
 		 491 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 		 490 aa  535  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  50.72 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 485 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  49.69 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  45.93 
 
 		 486 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  44.03 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  45.8 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.89 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 479 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.34 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 483 aa  309  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.28 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.71 
 
 		 491 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 		 466 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  39.03 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  40.43 
 
 		 498 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  40.08 
 
 		 481 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.19 
 
 		 480 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  40.19 
 
 		 488 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 492 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.98 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.83 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.94 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.19 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.36 
 
 		 480 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.08 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.98 
 
 		 480 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.98 
 
 		 480 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.4 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.4 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.94 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  42.72 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 503 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.23 
 
 		 483 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  38.56 
 
 		 482 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 		 489 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.77 
 
 		 480 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 		 484 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.57 
 
 		 486 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 		 486 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  38.82 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  42.43 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.47 
 
 		 483 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 483 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  37 
 
 		 483 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.41 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.58 
 
 		 491 aa  286  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.97 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.76 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.72 
 
 		 482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  42.39 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  37.95 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  39.81 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  38.31 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.02 
 
 		 487 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 		 488 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.6 
 
 		 485 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 		 480 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.25 
 
 		 488 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  35.51 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.18 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  34.04 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>