More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6645 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
490 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 
486 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.75 
 
 
493 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  56.54 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  55.74 
 
 
492 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.24 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.47 
 
 
489 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53.47 
 
 
489 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
489 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
492 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  52.86 
 
 
489 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.95 
 
 
491 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  52.62 
 
 
490 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  57.79 
 
 
488 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.47 
 
 
492 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  50.41 
 
 
491 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  48.97 
 
 
486 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
491 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  49.9 
 
 
487 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
483 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  45.33 
 
 
486 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  39.01 
 
 
486 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  40.94 
 
 
491 aa  359  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
480 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  48.62 
 
 
486 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  38.9 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
497 aa  333  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  41.04 
 
 
503 aa  333  6e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 
491 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  37.88 
 
 
496 aa  329  6e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
498 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
489 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  40.66 
 
 
485 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
496 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  40.5 
 
 
510 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 
489 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
497 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  41.19 
 
 
481 aa  319  7.999999999999999e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 
503 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  39.66 
 
 
482 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
481 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 
490 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  42.73 
 
 
488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.44 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  40.69 
 
 
482 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
510 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
480 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
482 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
489 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.43 
 
 
493 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
466 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
483 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  40.37 
 
 
508 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 
494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.85 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
483 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  41.68 
 
 
486 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 
496 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
483 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
483 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 
482 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  42.19 
 
 
486 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.93 
 
 
499 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
498 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
482 aa  280  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  39.31 
 
 
483 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  42.49 
 
 
484 aa  277  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
496 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  40.35 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.82 
 
 
488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
483 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
488 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.9 
 
 
500 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
489 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
489 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
483 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.62 
 
 
493 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
480 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  35.46 
 
 
488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
479 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  36.85 
 
 
510 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
503 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  35.63 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
483 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
483 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  35.78 
 
 
516 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
481 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>