More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2192 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  957    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  64.89 
 
 
487 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 
483 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  52.89 
 
 
490 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  53.81 
 
 
492 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  52.89 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  53.21 
 
 
488 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.43 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  54.02 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  54.43 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  58.06 
 
 
486 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.81 
 
 
492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  49.17 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  50.52 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  52.16 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  48.56 
 
 
486 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.29 
 
 
484 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  48.97 
 
 
490 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  47.69 
 
 
493 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  48.11 
 
 
493 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  47.19 
 
 
486 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
503 aa  360  3e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  41.37 
 
 
497 aa  353  5e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.09 
 
 
483 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  42.36 
 
 
503 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 
486 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  39.63 
 
 
486 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  40.9 
 
 
490 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  39.71 
 
 
491 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
496 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 
496 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
489 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  39.14 
 
 
485 aa  316  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
491 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
480 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
497 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  40.34 
 
 
482 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  43.43 
 
 
482 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  38.51 
 
 
481 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
483 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.57 
 
 
510 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
483 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  37.73 
 
 
493 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  42.58 
 
 
482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
480 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 
481 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  39.23 
 
 
498 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  38.75 
 
 
481 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
482 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
496 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
483 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.57 
 
 
493 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  39.36 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  42.04 
 
 
486 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  39.36 
 
 
482 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  40.39 
 
 
490 aa  269  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
479 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  40.72 
 
 
494 aa  267  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  39.68 
 
 
483 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.16 
 
 
493 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  35.56 
 
 
464 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.71 
 
 
482 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
480 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
486 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
483 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
468 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 
482 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  37.88 
 
 
508 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
496 aa  262  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  38.97 
 
 
488 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  41.51 
 
 
484 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.24 
 
 
498 aa  256  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.33 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  36.27 
 
 
516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  39.86 
 
 
483 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.01 
 
 
490 aa  253  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
498 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
510 aa  252  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
480 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.18 
 
 
500 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
486 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  37.7 
 
 
510 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.12 
 
 
482 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  41.36 
 
 
482 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
483 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 
489 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  34.81 
 
 
473 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
493 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
481 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  36.4 
 
 
496 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>