More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2977 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  65.92 
 
 		 489 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 		 491 aa  993    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  67.01 
 
 		 488 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  67.14 
 
 		 490 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  66.33 
 
 		 489 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 489 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  65.99 
 
 		 492 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  65.71 
 
 		 492 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  66.33 
 
 		 489 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.26 
 
 		 493 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  55.88 
 
 		 493 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  54.71 
 
 		 492 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  51.85 
 
 		 486 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.37 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  51.95 
 
 		 490 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.15 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  49.17 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  50.73 
 
 		 487 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  46.65 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  50.76 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  43.59 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 		 491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  42.24 
 
 		 486 aa  356  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  42.33 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  37.87 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.2 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  38.1 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  41.38 
 
 		 489 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 		 496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 		 497 aa  329  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  40.3 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  39.13 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  37.9 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  37.7 
 
 		 510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 		 483 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 		 480 aa  306  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  39.63 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  39.77 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  38.76 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.93 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 505 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  41.88 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  41.3 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  36.8 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  39.95 
 
 		 482 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.15 
 
 		 496 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  37 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  38.52 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  37 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  39.91 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.58 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  35.64 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 486 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.33 
 
 		 491 aa  272  9e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  35.6 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  35.25 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.06 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  37.82 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.74 
 
 		 493 aa  269  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 489 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 481 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  40.27 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 		 479 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.68 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 489 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.41 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 		 488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1759  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0255  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.45 
 
 		 489 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  37.88 
 
 		 482 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>