More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3717 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009955  Dshi_3717  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  980    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0853  aldehyde dehydrogenase  63.99 
 
 
486 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2925  aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
489 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3794  aldehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
479 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.735096  hitchhiker  0.00488906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
485 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4623  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 
496 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26150  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
491 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6463  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 
479 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0607788  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3062  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
485 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0742  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
492 aa  342  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.213961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
482 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3202  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2162  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein superfamily  44.33 
 
 
485 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.53 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.5 
 
 
496 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.43 
 
 
497 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 
495 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
494 aa  292  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  40.39 
 
 
529 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
504 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
473 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.69 
 
 
487 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.09 
 
 
508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.88 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.03 
 
 
490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.98 
 
 
494 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  35.86 
 
 
494 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 
491 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
500 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
500 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.98 
 
 
494 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
500 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  41.36 
 
 
492 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.44 
 
 
494 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.44 
 
 
494 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
482 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
484 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
467 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  35.64 
 
 
494 aa  279  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 
502 aa  279  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
490 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
494 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
500 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
494 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  37.85 
 
 
495 aa  276  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  35.83 
 
 
506 aa  276  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
494 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
494 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
494 aa  276  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3244  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.685717  normal  0.437136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3610  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  35.77 
 
 
503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.08 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.94 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  35.5 
 
 
506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
500 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.48 
 
 
483 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  35.29 
 
 
506 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
493 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  35.74 
 
 
501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.02 
 
 
498 aa  269  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2657  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
500 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.210437  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
497 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
480 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.26 
 
 
502 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2642  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
500 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667345  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2613  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
500 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 
510 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
504 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
497 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  36.27 
 
 
490 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  35.34 
 
 
499 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
479 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
480 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  35.34 
 
 
503 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 
496 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
482 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 
496 aa  266  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
482 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
494 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  36.06 
 
 
502 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
504 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
497 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.05 
 
 
480 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>