More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3202 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3202  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 500 aa  1013    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 		 485 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3062  aldehyde dehydrogenase  59.14 
 
 		 485 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2162  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein superfamily  57.86 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0742  aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 		 492 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4623  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6463  Aldehyde Dehydrogenase  46.75 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0607788  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26150  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2925  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3794  aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 		 479 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.735096  hitchhiker  0.00488906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0853  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3717  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 497 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 		 496 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.76 
 
 		 492 aa  300  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  37.08 
 
 		 493 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 490 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 488 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.97 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 		 480 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  36.84 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  34.34 
 
 		 502 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.74 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  36.21 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.22 
 
 		 490 aa  289  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  36.21 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 488 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.79 
 
 		 513 aa  286  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.01 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.83 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  36 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.39 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.4 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.34 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6479  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6714  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 511 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.84 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  33.07 
 
 		 494 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.66 
 
 		 503 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.62 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.2 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 484 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 488 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.61 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.39 
 
 		 508 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  38 
 
 		 483 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 		 480 aa  276  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 501 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  37.84 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22530  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  35.42 
 
 		 493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0499556  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  35.4 
 
 		 506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  33.68 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  34.45 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.58 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.74 
 
 		 489 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  34.11 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.59 
 
 		 482 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  34.49 
 
 		 510 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.93 
 
 		 497 aa  273  8.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  35.85 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  36.42 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.74 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.61 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20000  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.2 
 
 		 482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0263  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.37 
 
 		 490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.24 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.24 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.33 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  33.47 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  34.17 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 		 500 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2577  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 		 484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 		 493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2406  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 		 484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 474 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  34.81 
 
 		 492 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.08 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  36.93 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>