More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2364 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  981    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3062  aldehyde dehydrogenase  74.16 
 
 
485 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2162  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein superfamily  69.44 
 
 
485 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  71.4 
 
 
482 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0742  aldehyde dehydrogenase  59.83 
 
 
492 aa  588  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.213961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3202  aldehyde dehydrogenase  58.95 
 
 
500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4623  aldehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
496 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26150  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
491 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6463  Aldehyde Dehydrogenase  52 
 
 
479 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0607788  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0853  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
486 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3794  aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.735096  hitchhiker  0.00488906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2925  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
489 aa  345  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3717  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
485 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
494 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
491 aa  326  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 
480 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
497 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 
529 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.61 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  37.11 
 
 
506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  37.47 
 
 
493 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.11 
 
 
502 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  36.4 
 
 
506 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  35.44 
 
 
488 aa  299  9e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
496 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  35.44 
 
 
488 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.72 
 
 
487 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
493 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
493 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  37.45 
 
 
506 aa  296  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.34 
 
 
493 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 
490 aa  296  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
513 aa  295  8e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  38 
 
 
506 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  37.47 
 
 
493 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  38.49 
 
 
502 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
493 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.61 
 
 
498 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.13 
 
 
493 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.32 
 
 
496 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
504 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1625  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 
491 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
504 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
506 aa  289  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  36.71 
 
 
503 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
496 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 
473 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.19 
 
 
498 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
490 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
494 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  34.95 
 
 
502 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  36.86 
 
 
490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22530  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 
501 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  33.54 
 
 
503 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
494 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  34.86 
 
 
496 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  34.86 
 
 
496 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
500 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.04 
 
 
500 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.68 
 
 
488 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.63 
 
 
489 aa  280  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.869988  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.16 
 
 
493 aa  279  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.68 
 
 
496 aa  279  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 
488 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
507 aa  279  9e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
510 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
500 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
494 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
494 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
494 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.4 
 
 
494 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.11 
 
 
503 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
494 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3024  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
489 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35 
 
 
483 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6479  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
511 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6714  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
511 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.165404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
482 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  35.36 
 
 
494 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.03 
 
 
483 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.03 
 
 
483 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  35.2 
 
 
494 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  35.2 
 
 
494 aa  277  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.63 
 
 
488 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.4 
 
 
491 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  34.99 
 
 
494 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2507  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
496 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.982399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>