More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0853 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0853  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  983    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3717  aldehyde dehydrogenase  63.99 
 
 
485 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2925  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
485 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3062  aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 
485 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4623  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
496 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3794  aldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
479 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.735096  hitchhiker  0.00488906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37090  putative aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
482 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2162  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein superfamily  48.45 
 
 
485 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26150  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
491 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321659  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0742  aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 
492 aa  359  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.213961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6463  Aldehyde Dehydrogenase  42.27 
 
 
479 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0607788  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
491 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
494 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3202  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
500 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.96 
 
 
495 aa  333  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 
529 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
497 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.89 
 
 
487 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.3 
 
 
497 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
496 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
496 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.66 
 
 
488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
496 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
504 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.23 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
491 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
490 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.96 
 
 
493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 
496 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
508 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.22 
 
 
498 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  38.45 
 
 
506 aa  303  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
496 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  38.45 
 
 
506 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
494 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
490 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.41 
 
 
496 aa  300  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  39.45 
 
 
493 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
486 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3725  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
502 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
494 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.92 
 
 
510 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
500 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.74 
 
 
488 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
500 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.44 
 
 
494 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
500 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
500 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.65 
 
 
494 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 
504 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
500 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
482 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
493 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
494 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
479 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
494 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.65 
 
 
494 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.31 
 
 
494 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
494 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
494 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
494 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.09 
 
 
494 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
494 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.44 
 
 
494 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
494 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
494 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
494 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
494 aa  292  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
494 aa  292  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.09 
 
 
494 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
494 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
498 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
500 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.27 
 
 
505 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  37.18 
 
 
495 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
502 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
496 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 
492 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.32 
 
 
494 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
495 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
480 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  35.16 
 
 
508 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
483 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1051  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0159067  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.72 
 
 
502 aa  287  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  37.05 
 
 
503 aa  287  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.82 
 
 
488 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  34.79 
 
 
502 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
497 aa  286  8e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.09 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  36.65 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>