More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1049 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.9 
 
 
481 aa  665    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.09 
 
 
487 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 
475 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.08 
 
 
474 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1022    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.47 
 
 
480 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
475 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 
475 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 
474 aa  633  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.97 
 
 
474 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.76 
 
 
474 aa  614  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
474 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.25 
 
 
477 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
474 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  62.24 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
474 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  62.24 
 
 
474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.81 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
481 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.8 
 
 
481 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.8 
 
 
481 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
481 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.97 
 
 
474 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
481 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
474 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.88 
 
 
481 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 
474 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.28 
 
 
474 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.55 
 
 
474 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
478 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.44 
 
 
474 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
486 aa  566  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
479 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
470 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
514 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.01 
 
 
475 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
486 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
484 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
476 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
479 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
477 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
463 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  47.78 
 
 
492 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  47.78 
 
 
477 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  48.6 
 
 
478 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  49.01 
 
 
481 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
477 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.69 
 
 
476 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
478 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
485 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  47.16 
 
 
477 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  47.35 
 
 
480 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
506 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  45.86 
 
 
483 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  46.7 
 
 
476 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  45.78 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.64 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
477 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
477 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.99 
 
 
477 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.81 
 
 
468 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 
476 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
491 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  47.45 
 
 
472 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 
491 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  47.35 
 
 
480 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  43.69 
 
 
496 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
457 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
523 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
523 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
490 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.11 
 
 
502 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 
496 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.16 
 
 
496 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 
496 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
499 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.87 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
488 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.79 
 
 
495 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
491 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.71 
 
 
488 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.3 
 
 
494 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
488 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
496 aa  352  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
497 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>