More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1051 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1051  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
494 aa  1000    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0159067  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  47.05 
 
 
506 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  46.84 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  45.59 
 
 
506 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  45.59 
 
 
504 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  45.38 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.04 
 
 
506 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  46.99 
 
 
493 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
502 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4182  Aldehyde Dehydrogenase  44.98 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  decreased coverage  0.000171916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  44.74 
 
 
510 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5240  aldehyde dehydrogenase  46.04 
 
 
504 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.979881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
505 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  45.74 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.54 
 
 
508 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.57 
 
 
497 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.91 
 
 
497 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
494 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  43.07 
 
 
492 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
493 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
494 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.47 
 
 
490 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
517 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  46.3 
 
 
512 aa  392  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.95 
 
 
490 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  42.98 
 
 
493 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.86 
 
 
493 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
493 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
491 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
492 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.28 
 
 
496 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
490 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.23 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
497 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.26 
 
 
497 aa  383  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
494 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.81 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 
494 aa  385  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3937  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
516 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.51 
 
 
503 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 
502 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
494 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  42.49 
 
 
478 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.86 
 
 
493 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
505 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
493 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  45.21 
 
 
495 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
510 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.56 
 
 
496 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
483 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 
473 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.61 
 
 
490 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
492 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  41.49 
 
 
499 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
498 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
496 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.44 
 
 
493 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
507 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
500 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.29 
 
 
502 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
490 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.97 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
507 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.39 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  45.87 
 
 
499 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.37 
 
 
503 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  43.89 
 
 
505 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41.88 
 
 
488 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.88 
 
 
488 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  41.18 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.79 
 
 
503 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1278  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.44 
 
 
492 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000390072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.24 
 
 
495 aa  375  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.98 
 
 
507 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
492 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
495 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.3 
 
 
493 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
495 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
495 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  41.7 
 
 
486 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
495 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  42.89 
 
 
495 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
495 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.97 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
502 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
493 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
495 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  43.27 
 
 
491 aa  372  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>