More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5240 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5240  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
504 aa  1016    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.979881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  50.31 
 
 
506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
504 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  48.41 
 
 
506 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1481  Aldehyde Dehydrogenase  50.31 
 
 
506 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450354  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  48.41 
 
 
506 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.7 
 
 
506 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
502 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4182  Aldehyde Dehydrogenase  50.21 
 
 
502 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  decreased coverage  0.000171916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3937  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.52 
 
 
516 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  47.65 
 
 
505 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  46.17 
 
 
493 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1051  aldehyde dehydrogenase  46.04 
 
 
494 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0159067  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
491 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
494 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
494 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.98 
 
 
494 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
494 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  43.51 
 
 
473 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  42.71 
 
 
488 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.02 
 
 
496 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
490 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.35 
 
 
490 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  42.3 
 
 
488 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  41.47 
 
 
497 aa  382  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 
502 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 
494 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.04 
 
 
498 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.72 
 
 
490 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
493 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
494 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
501 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
498 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.78 
 
 
511 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
495 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.76 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.73 
 
 
492 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
494 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 
490 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.76 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  42.36 
 
 
510 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
497 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.34 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.88 
 
 
490 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 
492 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.55 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
493 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
488 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 
496 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.92 
 
 
509 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.27 
 
 
493 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
496 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.73 
 
 
510 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  42.51 
 
 
496 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.54 
 
 
508 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
493 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
493 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.51 
 
 
488 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
488 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
488 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
488 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
493 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.23 
 
 
504 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
501 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  40.04 
 
 
493 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
493 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.47 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.45 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  41.73 
 
 
498 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
493 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
497 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.68 
 
 
488 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  40.29 
 
 
493 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.9 
 
 
495 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.79 
 
 
493 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
497 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
491 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  43.32 
 
 
497 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
490 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  43.72 
 
 
492 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
490 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  39.33 
 
 
499 aa  352  7e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  41.89 
 
 
478 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
499 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.08 
 
 
497 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.78 
 
 
505 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 
496 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
501 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>