More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3636 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  69.32 
 
 
685 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.47 
 
 
679 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.88 
 
 
683 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.42 
 
 
678 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
675 aa  806    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  70.71 
 
 
687 aa  950    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 
682 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.77 
 
 
686 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
683 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
686 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
678 aa  1369    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.37 
 
 
664 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.31 
 
 
674 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.92 
 
 
690 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.91 
 
 
686 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  86.39 
 
 
678 aa  1179    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.4 
 
 
691 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.52 
 
 
686 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 
695 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.85 
 
 
676 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  84.49 
 
 
679 aa  1136    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.18 
 
 
678 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.73 
 
 
702 aa  637    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.81 
 
 
681 aa  720    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.61 
 
 
675 aa  703    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.95 
 
 
703 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.78 
 
 
686 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 
706 aa  650    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.25 
 
 
683 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.66 
 
 
684 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.37 
 
 
684 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.37 
 
 
684 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 
684 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
690 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 
688 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 
681 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 
681 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.44 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.29 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
683 aa  599  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
836 aa  535  1e-150  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
531 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
531 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 
531 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  47.13 
 
 
516 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  45.04 
 
 
517 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
523 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
518 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.99 
 
 
520 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  49.71 
 
 
515 aa  173  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  32.33 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.53 
 
 
485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  30.64 
 
 
510 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  30.17 
 
 
517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  30.15 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  29.89 
 
 
512 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3083  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
496 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  31.2 
 
 
495 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  31.2 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
496 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5132  aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 
499 aa  114  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223972  normal  0.0301886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
496 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
496 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  28.86 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.51 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  28.22 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  27.19 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  28.39 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  28.39 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4158  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.27 
 
 
511 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  30.93 
 
 
496 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28.22 
 
 
474 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 
499 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  30.93 
 
 
496 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  30.75 
 
 
475 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  28.43 
 
 
476 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  30.93 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  30.93 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
476 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  27.65 
 
 
496 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.43 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  26.61 
 
 
480 aa  110  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  27.72 
 
 
491 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.53 
 
 
466 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
476 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.51 
 
 
481 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  25.63 
 
 
479 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
488 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  27.93 
 
 
479 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
490 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>