More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1625 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  86.1 
 
 
519 aa  848    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  83.78 
 
 
520 aa  823    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
518 aa  1045    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  65.52 
 
 
531 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  84.07 
 
 
523 aa  811    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  76.64 
 
 
516 aa  756    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
531 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  65.42 
 
 
531 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
675 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.11 
 
 
679 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.3 
 
 
690 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.77 
 
 
681 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.72 
 
 
683 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
686 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.47 
 
 
686 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.33 
 
 
686 aa  385  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
686 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
688 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
678 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.35 
 
 
685 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
675 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.85 
 
 
681 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.85 
 
 
681 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.85 
 
 
681 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 
676 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
678 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.94 
 
 
684 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.05 
 
 
681 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
687 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
679 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
695 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.3 
 
 
691 aa  360  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.16 
 
 
678 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
686 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
674 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
682 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.3 
 
 
517 aa  349  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.42 
 
 
683 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
678 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 
702 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.75 
 
 
664 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
836 aa  342  9e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
703 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.86 
 
 
683 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
690 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
683 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 
706 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.66 
 
 
684 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
684 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
684 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
470 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  28.27 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
505 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  27.77 
 
 
505 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  27.73 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  26.42 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.26 
 
 
505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.44 
 
 
481 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
485 aa  109  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 
476 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  25.7 
 
 
512 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
500 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
497 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.87 
 
 
510 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  27.6 
 
 
495 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2878  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.74 
 
 
473 aa  107  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0192493  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
473 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.05 
 
 
476 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  23.85 
 
 
479 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  28.12 
 
 
480 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.02 
 
 
483 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  27.05 
 
 
476 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.2 
 
 
529 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.63 
 
 
500 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  27.85 
 
 
483 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  26.72 
 
 
477 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
486 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  26.53 
 
 
490 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.63 
 
 
496 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  25.7 
 
 
492 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  26.59 
 
 
505 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  27.44 
 
 
489 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4410  Aldehyde Dehydrogenase  30.61 
 
 
491 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
489 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
489 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  27.18 
 
 
489 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
483 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2689  aldehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
798 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.583529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.18 
 
 
472 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
490 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  27.42 
 
 
477 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  24.23 
 
 
474 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
490 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
484 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  26.74 
 
 
477 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
502 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  29.46 
 
 
478 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>