More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1420 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  92.82 
 
 
531 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  67.62 
 
 
519 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
520 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
531 aa  1068    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  86.34 
 
 
531 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  65.13 
 
 
518 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  64.75 
 
 
516 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  66.1 
 
 
523 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.21 
 
 
679 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.35 
 
 
681 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.65 
 
 
686 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 
678 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.28 
 
 
686 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 
675 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 
684 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.26 
 
 
686 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.96 
 
 
687 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.86 
 
 
686 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
679 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.41 
 
 
674 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.26 
 
 
675 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.61 
 
 
678 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
683 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.72 
 
 
691 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.74 
 
 
695 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.38 
 
 
676 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.77 
 
 
690 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
685 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
682 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.34 
 
 
678 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
681 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 
681 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
678 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.54 
 
 
681 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.4 
 
 
686 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.54 
 
 
681 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.26 
 
 
688 aa  363  4e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.89 
 
 
683 aa  362  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43 
 
 
664 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.34 
 
 
702 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.56 
 
 
690 aa  356  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
706 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.27 
 
 
703 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.92 
 
 
683 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  40.27 
 
 
836 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.49 
 
 
683 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  42.72 
 
 
517 aa  336  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.72 
 
 
684 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
684 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.34 
 
 
684 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
476 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.29 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
476 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  27.1 
 
 
476 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
487 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  27.99 
 
 
470 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.18 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  27.36 
 
 
496 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  28.82 
 
 
490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
487 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.42 
 
 
485 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  28.82 
 
 
490 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  28.82 
 
 
490 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  25.25 
 
 
491 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
470 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
502 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  26.71 
 
 
493 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.52 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  27.76 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  24.62 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  24.62 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0890  putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  25.96 
 
 
488 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
490 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2012  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  26.22 
 
 
490 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.981188 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.36 
 
 
505 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  32.57 
 
 
487 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  25 
 
 
486 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  24.85 
 
 
506 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3472  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.33 
 
 
791 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  27.89 
 
 
529 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3740  aldehyde dehydrogenase  29.33 
 
 
791 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.977934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
493 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  26.72 
 
 
494 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  27.55 
 
 
494 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  30.35 
 
 
476 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
490 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
478 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
478 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  26.72 
 
 
494 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  26.71 
 
 
472 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3519  aldehyde dehydrogenase  25.88 
 
 
496 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.116391 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  26.36 
 
 
505 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  24.77 
 
 
475 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  26.83 
 
 
499 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
494 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  27.94 
 
 
505 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  26.9 
 
 
494 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  23.6 
 
 
488 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>