More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4804 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.23 
 
 
681 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
684 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.41 
 
 
675 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.18 
 
 
679 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.42 
 
 
686 aa  742    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
681 aa  668    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.78 
 
 
684 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.47 
 
 
683 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 
683 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.52 
 
 
683 aa  750    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.07 
 
 
688 aa  655    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.26 
 
 
678 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.85 
 
 
690 aa  782    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
681 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.88 
 
 
690 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
681 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.77 
 
 
684 aa  707    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.32 
 
 
678 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  62.23 
 
 
686 aa  813    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
664 aa  711    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 
674 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.24 
 
 
679 aa  758    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.17 
 
 
706 aa  699    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.96 
 
 
678 aa  773    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  74.37 
 
 
686 aa  1008    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 
678 aa  752    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  83.46 
 
 
691 aa  1137    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.79 
 
 
687 aa  778    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
684 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.91 
 
 
681 aa  832    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.71 
 
 
682 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.49 
 
 
695 aa  731    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 
676 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
702 aa  697    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.73 
 
 
686 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
703 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.67 
 
 
685 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
686 aa  1398    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.77 
 
 
675 aa  802    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
683 aa  651    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
836 aa  613  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 
531 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
531 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
519 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  45.12 
 
 
516 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
518 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.53 
 
 
517 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
523 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
520 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  58.89 
 
 
515 aa  231  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  31.47 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  29.56 
 
 
494 aa  134  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  29.7 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.6 
 
 
500 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
491 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
491 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
510 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.35 
 
 
529 aa  123  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  30.03 
 
 
478 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0685  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.16 
 
 
485 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3519  aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
496 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.116391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  31.79 
 
 
473 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  31.33 
 
 
487 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  31.47 
 
 
487 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 
487 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  29.19 
 
 
517 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
504 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
463 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.89 
 
 
472 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.41 
 
 
472 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  32.08 
 
 
485 aa  117  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
477 aa  117  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
495 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
495 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  28.6 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  29.54 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0890  putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  27.08 
 
 
488 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  27.92 
 
 
496 aa  114  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
491 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 
476 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 
491 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1701  aldehyde dehydrogenase, NAD-linked  26.12 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  28.71 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  29.15 
 
 
483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3194  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.25 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.14 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1338  Aldehyde Dehydrogenase  29.57 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2012  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
490 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.981188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  29.32 
 
 
510 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
478 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
478 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
485 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>