More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1515 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.44 
 
 
678 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.94 
 
 
681 aa  768    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
684 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.89 
 
 
686 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.9 
 
 
684 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
675 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.79 
 
 
681 aa  764    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.12 
 
 
684 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.74 
 
 
685 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 
686 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.77 
 
 
678 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.13 
 
 
679 aa  661    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
678 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  53.58 
 
 
836 aa  690    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.18 
 
 
691 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  65.98 
 
 
695 aa  877    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
676 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.32 
 
 
678 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.96 
 
 
682 aa  747    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.77 
 
 
675 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.7 
 
 
681 aa  688    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
690 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
681 aa  766    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.5 
 
 
690 aa  823    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.75 
 
 
686 aa  737    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.92 
 
 
684 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  81.44 
 
 
679 aa  1130    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.42 
 
 
686 aa  721    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.92 
 
 
687 aa  705    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
681 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
686 aa  1404    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.43 
 
 
683 aa  723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
683 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.16 
 
 
683 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 
683 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
664 aa  629  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.15 
 
 
674 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.92 
 
 
706 aa  605  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.34 
 
 
702 aa  601  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.95 
 
 
703 aa  588  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 
688 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
531 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
531 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
518 aa  363  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.95 
 
 
519 aa  360  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
523 aa  352  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
516 aa  349  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
520 aa  346  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
517 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 
487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.06 
 
 
493 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  42.62 
 
 
515 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  29.31 
 
 
493 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4475  aldehyde dehydrogenase  28.49 
 
 
476 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0742  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
476 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  28.02 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0742  aldehyde dehydrogenase  28.22 
 
 
476 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0948493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0708  betaine-aldehyde dehydrogenase, putative  27.77 
 
 
476 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
485 aa  127  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  26.18 
 
 
496 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.41 
 
 
483 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  29.16 
 
 
464 aa  124  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
487 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  29.81 
 
 
504 aa  122  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
483 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
491 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
491 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  26.64 
 
 
496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.19 
 
 
517 aa  121  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  26.64 
 
 
496 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
488 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  29.81 
 
 
478 aa  120  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  27.09 
 
 
495 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  29.95 
 
 
491 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
502 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2186  aldehyde dehydrogenase  30.39 
 
 
470 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0362703  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  27.56 
 
 
478 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  27.56 
 
 
478 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  27.23 
 
 
488 aa  118  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  27.22 
 
 
496 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1287  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.65 
 
 
492 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.22 
 
 
472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  27.19 
 
 
475 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  27.19 
 
 
475 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  25.3 
 
 
506 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  27.43 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  27.48 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  28.13 
 
 
512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  28.41 
 
 
486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  25.66 
 
 
475 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  27.15 
 
 
488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  28.26 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  30.05 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
491 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
470 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  28.02 
 
 
476 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.25 
 
 
477 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1771  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>