More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0934 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.74 
 
 
681 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.88 
 
 
681 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 
684 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.6 
 
 
686 aa  805    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.08 
 
 
690 aa  764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  71.91 
 
 
686 aa  994    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
690 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.8 
 
 
679 aa  751    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.59 
 
 
678 aa  738    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54 
 
 
706 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 
702 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 
687 aa  751    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.36 
 
 
684 aa  686    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  83.46 
 
 
686 aa  1156    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 
675 aa  790    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
688 aa  666    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.36 
 
 
683 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.29 
 
 
683 aa  691    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
684 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.74 
 
 
681 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.4 
 
 
678 aa  719    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 
664 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 
674 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.71 
 
 
675 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.44 
 
 
679 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 
684 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 
686 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.14 
 
 
678 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
691 aa  1412    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.74 
 
 
681 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.98 
 
 
695 aa  706    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.04 
 
 
676 aa  750    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.09 
 
 
682 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.99 
 
 
683 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.18 
 
 
686 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.7 
 
 
678 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 
681 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.64 
 
 
703 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.27 
 
 
685 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.63 
 
 
683 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  50.51 
 
 
836 aa  631  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
531 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
531 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
519 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 
518 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  44.14 
 
 
517 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
516 aa  364  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
520 aa  360  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
523 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  57.78 
 
 
515 aa  229  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  29.03 
 
 
529 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.22 
 
 
495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
517 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.76 
 
 
500 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  28.19 
 
 
487 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  29.72 
 
 
491 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  29.72 
 
 
491 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  28.22 
 
 
487 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  29.44 
 
 
491 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  30.48 
 
 
512 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  29.06 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  29.82 
 
 
485 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.84 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3732  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
485 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.32 
 
 
474 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.18 
 
 
492 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  27.64 
 
 
474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
496 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
472 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  28.21 
 
 
510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  30.91 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  27.48 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  27.48 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  26.28 
 
 
496 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  26.28 
 
 
496 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
491 aa  114  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  31.86 
 
 
468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  29.77 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  27.12 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.44 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3952  Aldehyde Dehydrogenase  31.39 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3778  aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0616063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1287  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 
492 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
493 aa  111  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
493 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  26.42 
 
 
491 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  25.11 
 
 
490 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4733  Aldehyde Dehydrogenase  27.04 
 
 
506 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.29898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  31.79 
 
 
476 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
495 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2364  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 
485 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.113062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1545  aldehyde dehydrogenase  26.98 
 
 
484 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162133 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1153  Aldehyde Dehydrogenase  28.2 
 
 
474 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.720982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  27.23 
 
 
494 aa  110  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  30.21 
 
 
496 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>