More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1287 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1287  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
492 aa  1002    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  40.63 
 
 
502 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  42.03 
 
 
510 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 
494 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5222  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.22 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.02 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
487 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 
483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.02 
 
 
494 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
510 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.09 
 
 
473 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 
468 aa  322  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
494 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  37.4 
 
 
494 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
505 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.48 
 
 
494 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.16 
 
 
496 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
483 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 
497 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.48 
 
 
510 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
498 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
475 aa  315  9e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
475 aa  315  9e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  38.97 
 
 
488 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 
475 aa  312  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.57 
 
 
494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.8 
 
 
494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
477 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.29 
 
 
483 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.07 
 
 
490 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6842  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 
494 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  38.51 
 
 
508 aa  310  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7969  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
477 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
494 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.59 
 
 
494 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0902  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.52 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.864011  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1284  aldehyde dehydrogenase  41.95 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.16 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 
495 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  36.49 
 
 
495 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
488 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
501 aa  306  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
494 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.16 
 
 
494 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
496 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
496 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  38.16 
 
 
511 aa  305  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.87 
 
 
488 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 
494 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  37.26 
 
 
506 aa  302  8.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
488 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
494 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
493 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  37.74 
 
 
490 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
491 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
488 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
499 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
477 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
488 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 
483 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
489 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
472 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  42.32 
 
 
478 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
488 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3249  aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 
476 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0631  aldehyde dehydrogenase family protein  37.27 
 
 
481 aa  299  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  36.98 
 
 
488 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 
490 aa  299  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4844  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
496 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.013402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
484 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
467 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.9 
 
 
490 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  40.29 
 
 
513 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
494 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.19 
 
 
488 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5977  Aldehyde Dehydrogenase  42.21 
 
 
475 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
471 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17840  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
517 aa  297  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.522352  normal  0.643392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>