More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1818 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.74 
 
 
474 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
474 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  73.63 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 
474 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
474 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  67.72 
 
 
474 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  73.63 
 
 
474 aa  728    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  96.41 
 
 
474 aa  947    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.21 
 
 
481 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  68.57 
 
 
481 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  71.1 
 
 
474 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
481 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.2 
 
 
474 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.84 
 
 
481 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
474 aa  727    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  976    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.63 
 
 
481 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  63 
 
 
480 aa  641    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73 
 
 
474 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  82.91 
 
 
474 aa  806    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
481 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73 
 
 
474 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
474 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.06 
 
 
481 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.21 
 
 
474 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  68.14 
 
 
474 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 
474 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  82.01 
 
 
478 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
475 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 
475 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.81 
 
 
475 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.76 
 
 
495 aa  614  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
477 aa  601  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
474 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.19 
 
 
486 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 
470 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.09 
 
 
470 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 
514 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.96 
 
 
514 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
475 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
479 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
482 aa  501  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  52.77 
 
 
479 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  52.52 
 
 
477 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
479 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
477 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
477 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
486 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  52.88 
 
 
478 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 
483 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  49.36 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  51.08 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  49.16 
 
 
492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
484 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.32 
 
 
476 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.3 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 
463 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
506 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
476 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  48.3 
 
 
480 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  50.87 
 
 
472 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.23 
 
 
468 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  48.39 
 
 
476 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.31 
 
 
490 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  50.43 
 
 
480 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
479 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 
491 aa  413  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  46.04 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.75 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  51.23 
 
 
457 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.57 
 
 
498 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.46 
 
 
494 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.25 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.46 
 
 
494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.04 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.96 
 
 
496 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
502 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
523 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
523 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.13 
 
 
483 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.42 
 
 
490 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.02 
 
 
494 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>