More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3642 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  76.58 
 
 
474 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.79 
 
 
474 aa  750    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  76.58 
 
 
474 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.04 
 
 
474 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.79 
 
 
481 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  71.1 
 
 
474 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.37 
 
 
474 aa  744    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.95 
 
 
474 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.37 
 
 
481 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.27 
 
 
481 aa  659    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.37 
 
 
474 aa  746    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.9 
 
 
480 aa  663    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.79 
 
 
481 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  79.75 
 
 
474 aa  780    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 
474 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.41 
 
 
474 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.58 
 
 
481 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  976    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.74 
 
 
474 aa  781    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.16 
 
 
474 aa  742    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.37 
 
 
474 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.25 
 
 
474 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.04 
 
 
481 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  76.58 
 
 
474 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.79 
 
 
481 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.89 
 
 
474 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.74 
 
 
474 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.8 
 
 
478 aa  746    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
495 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.49 
 
 
475 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
475 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
475 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.2 
 
 
477 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.47 
 
 
487 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.65 
 
 
474 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
486 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
475 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.15 
 
 
470 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.94 
 
 
470 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
514 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
514 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.72 
 
 
470 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.72 
 
 
470 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.72 
 
 
470 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 
479 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
482 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  53.63 
 
 
479 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  51.71 
 
 
477 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  55.09 
 
 
478 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  52.52 
 
 
477 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.66 
 
 
479 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
484 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.83 
 
 
486 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  52.61 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  50.33 
 
 
477 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 
483 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.86 
 
 
476 aa  455  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
485 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
506 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  49.36 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  49.36 
 
 
480 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 
477 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  48.1 
 
 
492 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 
476 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.52 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  52.78 
 
 
480 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 
476 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  49.78 
 
 
472 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
491 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
479 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  46.91 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
491 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  46.7 
 
 
496 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.85 
 
 
490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  51.01 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
523 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 
496 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.26 
 
 
498 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.75 
 
 
490 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 
500 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
504 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 
500 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
494 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.53 
 
 
494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.83 
 
 
503 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
494 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
494 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
488 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>