More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1880 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  82.11 
 
 
477 aa  813    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  69.46 
 
 
483 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  68.01 
 
 
477 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
479 aa  631  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  64 
 
 
477 aa  614  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.79 
 
 
484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  65.05 
 
 
481 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  62.06 
 
 
478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.33 
 
 
477 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  61.47 
 
 
476 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 
478 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 
479 aa  555  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.75 
 
 
506 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
477 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.19 
 
 
476 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
477 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 
477 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
477 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 
476 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  59.33 
 
 
480 aa  529  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  58.4 
 
 
480 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  57.05 
 
 
476 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  60.88 
 
 
457 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
480 aa  497  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  54.94 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
481 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
479 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
475 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
474 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
482 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.25 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
474 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.79 
 
 
475 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
481 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.12 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  444  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.67 
 
 
478 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  49.46 
 
 
474 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 
474 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
476 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
477 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
487 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.34 
 
 
486 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
514 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
514 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.72 
 
 
486 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.39 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  48.94 
 
 
496 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  47.66 
 
 
492 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.34 
 
 
491 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.45 
 
 
468 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
490 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
463 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
475 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
491 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
523 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
523 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.59 
 
 
502 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0599  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
506 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213204  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
495 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
495 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.01 
 
 
503 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.19 
 
 
473 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.87 
 
 
490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  38.99 
 
 
499 aa  339  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4570  aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
504 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  41.25 
 
 
495 aa  336  5e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
490 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
488 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
488 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
488 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
488 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>