More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1729 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  83.97 
 
 		 481 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  83.97 
 
 		 481 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  83.97 
 
 		 481 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  98.95 
 
 		 474 aa  967    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  98.73 
 
 		 474 aa  965    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  99.16 
 
 		 474 aa  968    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 474 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 474 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  87.55 
 
 		 474 aa  851    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.12 
 
 		 480 aa  649    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  99.16 
 
 		 474 aa  971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.42 
 
 		 474 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73.83 
 
 		 478 aa  715    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  72.78 
 
 		 474 aa  742    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  99.16 
 
 		 474 aa  971    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 		 474 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  83.97 
 
 		 481 aa  822    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.46 
 
 		 474 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  977    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.37 
 
 		 474 aa  765    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 481 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  98.95 
 
 		 474 aa  967    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  83.54 
 
 		 481 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.68 
 
 		 474 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.75 
 
 		 481 aa  663    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  99.37 
 
 		 474 aa  972    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  67.51 
 
 		 474 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  73 
 
 		 474 aa  742    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 		 495 aa  621  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.03 
 
 		 487 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.97 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.76 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.04 
 
 		 477 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.28 
 
 		 475 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.09 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.66 
 
 		 470 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.29 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.29 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.14 
 
 		 479 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  54 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  51.17 
 
 		 479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  51.1 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 		 492 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.42 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  50.65 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 		 490 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  48.94 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.7 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  46.9 
 
 		 476 aa  435  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  48.82 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  49.23 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  50.33 
 
 		 480 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  48.18 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  48.79 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.92 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.18 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 494 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 494 aa  362  9e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 494 aa  362  9e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.97 
 
 		 494 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.97 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.97 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.3 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>