More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0279 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  71.28 
 
 
483 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  990    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  69.6 
 
 
478 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  68.99 
 
 
481 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  68.44 
 
 
476 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  72 
 
 
479 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  68.29 
 
 
478 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  70.25 
 
 
477 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  65.82 
 
 
477 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.64 
 
 
477 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  66.95 
 
 
476 aa  630  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  63.85 
 
 
477 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.37 
 
 
506 aa  619  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 
479 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  66.32 
 
 
477 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  66.32 
 
 
477 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  66.32 
 
 
477 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.72 
 
 
477 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.79 
 
 
485 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  62.08 
 
 
480 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  63.9 
 
 
480 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  56.75 
 
 
476 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  59.32 
 
 
479 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  56.96 
 
 
476 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  64.18 
 
 
457 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 
479 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
480 aa  495  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  54 
 
 
482 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.91 
 
 
481 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
474 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
474 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  55.36 
 
 
472 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.44 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.11 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  55.22 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
495 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
474 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
474 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
474 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.07 
 
 
474 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
475 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.04 
 
 
474 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
474 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
474 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  50.64 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
474 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
481 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  50.85 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
481 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.61 
 
 
474 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
481 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
478 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
474 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
481 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.29 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
474 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
477 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
491 aa  445  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.76 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
470 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
490 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  49.15 
 
 
492 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
475 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
490 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 
502 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
470 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 
491 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
463 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  48.93 
 
 
496 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.89 
 
 
468 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
502 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 
473 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.02 
 
 
501 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.49 
 
 
494 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
490 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
489 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
489 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  40.13 
 
 
492 aa  349  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.19 
 
 
492 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
494 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.07 
 
 
497 aa  347  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
497 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
490 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 
489 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>