More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3647 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  76.09 
 
 
495 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  1002    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.27 
 
 
475 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.42 
 
 
474 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.42 
 
 
475 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.63 
 
 
475 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.4 
 
 
480 aa  629  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.13 
 
 
481 aa  628  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.06 
 
 
474 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
474 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.46 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.46 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  64.06 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.03 
 
 
474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  63.46 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  63.46 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.47 
 
 
474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  63.46 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.03 
 
 
474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.25 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.13 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
481 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.21 
 
 
474 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.47 
 
 
481 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.68 
 
 
481 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  63.37 
 
 
481 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.47 
 
 
481 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
477 aa  599  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.26 
 
 
481 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  61.52 
 
 
478 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.41 
 
 
474 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
474 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  60.85 
 
 
474 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  58.77 
 
 
474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  59.46 
 
 
486 aa  571  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.6 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.39 
 
 
470 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
514 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
514 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
470 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
470 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
470 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
479 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
482 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
475 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.83 
 
 
486 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
484 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
479 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
477 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  46.93 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
478 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.32 
 
 
477 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
478 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.44 
 
 
476 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.53 
 
 
463 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  47.02 
 
 
477 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.81 
 
 
476 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  47.08 
 
 
481 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
477 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
477 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.58 
 
 
477 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  45.32 
 
 
476 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  45.24 
 
 
477 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  46.85 
 
 
479 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.52 
 
 
506 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  44.96 
 
 
483 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 
485 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  46.4 
 
 
480 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.36 
 
 
468 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
490 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
476 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
479 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  47.37 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
491 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
476 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
491 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  46.32 
 
 
472 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 
496 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
490 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
457 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
523 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
523 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  41.15 
 
 
503 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.09 
 
 
499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
491 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
496 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.22 
 
 
496 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
496 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.05 
 
 
495 aa  350  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
496 aa  348  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
499 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 
495 aa  346  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  38.09 
 
 
495 aa  346  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.17 
 
 
494 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.21 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>